科学小常识第3弹parallel让你的生

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之前用cellchat计算互作强度,由于细胞比较多,10W+,服务器大概算出结果要两天多,50小时左右。如果自己可以容忍这种速度,你导可以容忍两天多才才出结果吗?显然不可以。所以只能使用R里面的多线程工具parallel。服务器CPU型号:24Intel(R)Xeon(R)GoldCPU

2.60GHz,逻辑CPU个数24,内存使用情况:

suppressPackageStartupMessages({library(CellChat)library(parallel)})#functionforcellchat-objectcalculationCellchatParallel=function(x){suppressPackageStartupMessages(library(CellChat))x=identifyOverExpressedGenes(x)x=identifyOverExpressedInteractions(x)x=projectData(x,PPI.mouse)x=


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